داستان این فیلم درباره شاگرد یک کارگاه کوزه گری است. وی مدام و ناگریز در رویاهای ادبی، موسیقیایی غوطه ور است. آیا او مبتلا به گونه ای از بیماری روانیست، نظر پزشکان او چیست؟ آیا فقط عاشق پیشه است؟ آیا موفق می شود فرزندش را بعد از عمل جراحی زنده ببیند؟ و یا آیا ضمیر ناخوداگاه او همچون چاهی عظیم او را به خود بلعیده؟
فیلم سینمایی سوررئال "ریشه" اولین فیلم سینمایی بلند موسیقیایی ایرانی مملو از اسرار و رموز فلسفی، ادبیاتی در دنیایی متوهم است.